Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis
Ulat grayak jagung Spodoptera frugiperda J.E. Smith (Lepidoptera: Noctuide) saat ini, sudah ditemukan hampir di setap provinsi di Indonesia. Keberadaan S. frugiperda di Pulau Jawa belum banyak dilaporkan secara ilmiah. Teknik identifikasi secara molekuler merupakan salah satu teknik yang cepat dan...
Saved in:
| Main Authors: | , , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Universitas Andalas
2022-06-01
|
| Series: | Jurnal Proteksi Tanaman |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://jpt.faperta.unand.ac.id/index.php/jpt/article/view/89 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| _version_ | 1823857092860051456 |
|---|---|
| author | Ani Widarti Enie Tauruslina Idah Faridah Willing Bagariang Hadi Suyanto Didah Mahmudah Rista Susanti Rosalia Maryana Carwika Carwika |
| author_facet | Ani Widarti Enie Tauruslina Idah Faridah Willing Bagariang Hadi Suyanto Didah Mahmudah Rista Susanti Rosalia Maryana Carwika Carwika |
| author_sort | Ani Widarti |
| collection | DOAJ |
| description |
Ulat grayak jagung Spodoptera frugiperda J.E. Smith (Lepidoptera: Noctuide) saat ini, sudah ditemukan hampir di setap provinsi di Indonesia. Keberadaan S. frugiperda di Pulau Jawa belum banyak dilaporkan secara ilmiah. Teknik identifikasi secara molekuler merupakan salah satu teknik yang cepat dan akurat sehingga dapat menghasilkan data yang relatif akurat dan konsisten untuk identifikasi tingkat spesies. Selanjutnya ,data tersebut dapat digunakan sebagai dasar penyusunan strategi pengendalian base on gen diversity. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies ulat grayak S. frugiperda yang berasal dari Pulau Jawa, Indonesia secara molekuler dengan teknik polymerase chain reaction (PCR). Primer universal dari gen mitokondria sub unit Cytochrome oxidase I (COI) LCO 1490 (5’-GGT CAA CAA ATC ATA AAG ATA TTG G -3’) dan HCO 2198 (5’-TAA ACT TCA GGG TGA CCA AAA AAT CA-3’) dengan target 650 bp digunakan untuk menetukan identitas 6 (enam) ulat grayak jagung yang berasal dari Provinsi Jawa Barat Kabupaten Cirebon (JWB1) dan Garut (JWB2), Provinsi Jawa Tengah Kabupaten Wonogiri (JWTH), Provinsi Jawa Timur Kabupaten Gresik (JWTR), Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta Kabupaten Bantul (DIY), dan Provinsi Banten Kabupaten Serang (BNT). Hasil penelitian menunjukkan bahwa keenam sampel ulat grayak jagung asal pulau Jawa teridentifikasi sebagai Spodoptera frugiperda. Analisis pohon filogenetik dengan metode neihgbour joining tree menggambarkan bahwa S. frugiperda asal Jawa Tengah (JWTH), Banten (BNT), Jawa Barat 1 (JWB1), dan Yogyakarta (DIY) memiliki kedekatan dengan S. frugiperda isolat Solok (No. Acc. MW876212.1) dan Pasaman Barat (No. Acc. MW876211.1). Sedangkan S. frugiperda Jawa Barat2 (JWB2) dan Jawa Timur memiliki kedekatan dengan S. frugiperda isolat India (No. Acc. MT7324761), Padang Pariaman (No. Acc. MW876208.1), dan Tanah Datar (No. Acc. MW876210.1).
|
| format | Article |
| id | doaj-art-ce6b7c5bc6b646f18e39fc33b29f61b6 |
| institution | Kabale University |
| issn | 2580-0604 2621-3141 |
| language | English |
| publishDate | 2022-06-01 |
| publisher | Universitas Andalas |
| record_format | Article |
| series | Jurnal Proteksi Tanaman |
| spelling | doaj-art-ce6b7c5bc6b646f18e39fc33b29f61b62025-02-12T00:20:30ZengUniversitas AndalasJurnal Proteksi Tanaman2580-06042621-31412022-06-016110.25077/jpt.6.1.43-52.202289Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence AnalysisAni WidartiEnie TauruslinaIdah FaridahWilling BagariangHadi SuyantoDidah MahmudahRista SusantiRosalia MaryanaCarwika Carwika Ulat grayak jagung Spodoptera frugiperda J.E. Smith (Lepidoptera: Noctuide) saat ini, sudah ditemukan hampir di setap provinsi di Indonesia. Keberadaan S. frugiperda di Pulau Jawa belum banyak dilaporkan secara ilmiah. Teknik identifikasi secara molekuler merupakan salah satu teknik yang cepat dan akurat sehingga dapat menghasilkan data yang relatif akurat dan konsisten untuk identifikasi tingkat spesies. Selanjutnya ,data tersebut dapat digunakan sebagai dasar penyusunan strategi pengendalian base on gen diversity. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies ulat grayak S. frugiperda yang berasal dari Pulau Jawa, Indonesia secara molekuler dengan teknik polymerase chain reaction (PCR). Primer universal dari gen mitokondria sub unit Cytochrome oxidase I (COI) LCO 1490 (5’-GGT CAA CAA ATC ATA AAG ATA TTG G -3’) dan HCO 2198 (5’-TAA ACT TCA GGG TGA CCA AAA AAT CA-3’) dengan target 650 bp digunakan untuk menetukan identitas 6 (enam) ulat grayak jagung yang berasal dari Provinsi Jawa Barat Kabupaten Cirebon (JWB1) dan Garut (JWB2), Provinsi Jawa Tengah Kabupaten Wonogiri (JWTH), Provinsi Jawa Timur Kabupaten Gresik (JWTR), Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta Kabupaten Bantul (DIY), dan Provinsi Banten Kabupaten Serang (BNT). Hasil penelitian menunjukkan bahwa keenam sampel ulat grayak jagung asal pulau Jawa teridentifikasi sebagai Spodoptera frugiperda. Analisis pohon filogenetik dengan metode neihgbour joining tree menggambarkan bahwa S. frugiperda asal Jawa Tengah (JWTH), Banten (BNT), Jawa Barat 1 (JWB1), dan Yogyakarta (DIY) memiliki kedekatan dengan S. frugiperda isolat Solok (No. Acc. MW876212.1) dan Pasaman Barat (No. Acc. MW876211.1). Sedangkan S. frugiperda Jawa Barat2 (JWB2) dan Jawa Timur memiliki kedekatan dengan S. frugiperda isolat India (No. Acc. MT7324761), Padang Pariaman (No. Acc. MW876208.1), dan Tanah Datar (No. Acc. MW876210.1). https://jpt.faperta.unand.ac.id/index.php/jpt/article/view/89cytochrome oxidase I (COI), fall armyworm, PCR, Pulau Jawa |
| spellingShingle | Ani Widarti Enie Tauruslina Idah Faridah Willing Bagariang Hadi Suyanto Didah Mahmudah Rista Susanti Rosalia Maryana Carwika Carwika Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis Jurnal Proteksi Tanaman cytochrome oxidase I (COI), fall armyworm, PCR, Pulau Jawa |
| title | Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis |
| title_full | Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis |
| title_fullStr | Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis |
| title_full_unstemmed | Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis |
| title_short | Identification and Phylogenetic Tree Determination of Spodoptera frugiperda from Java Based on mtDNA COI Sequence Analysis |
| title_sort | identification and phylogenetic tree determination of spodoptera frugiperda from java based on mtdna coi sequence analysis |
| topic | cytochrome oxidase I (COI), fall armyworm, PCR, Pulau Jawa |
| url | https://jpt.faperta.unand.ac.id/index.php/jpt/article/view/89 |
| work_keys_str_mv | AT aniwidarti identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT enietauruslina identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT idahfaridah identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT willingbagariang identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT hadisuyanto identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT didahmahmudah identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT ristasusanti identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT rosaliamaryana identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis AT carwikacarwika identificationandphylogenetictreedeterminationofspodopterafrugiperdafromjavabasedonmtdnacoisequenceanalysis |